Världskulturmuseerna arbetar självständigt och tillsammans hyresvärdarna för att kontinuerligt minska miljöpåverkan från museernas drift. De gemensamma insatserna regleras i hyreskontrakten och hanterar tex åtgärder för att kunna följa och minska energiåtgång, förbättrande åtgärder för avfallshantering och tydliggörande av att miljöhänsyn ska tas vid nyanskaffning och materialval.
I alla museerna och i det externa magasin som myndigheten hyr i Mölndal utanför Göteborg, pågår arbete med att byta ut äldre armaturer och belysning till LED-belysning som kräver mindre energi och håller längre. På Etnografiska museet finns sedan länge solcellspaneler som minskar behovet av inköpt el. Världskulturmuseerna och Statens fastighetsverk köper sin el från förnybara källor. Insatser har också påbörjats för att ta större grepp om klimatanläggningarna för museerna, för att bättre kunna anpassa energiförbrukningen efter behov i olika utrymmen, och undvika att det förbrukas mer än nödvändigt.
Andra insatser som görs för att minska energiförbrukningen handlar om att förbättra möjligheterna till minskad energiförbrukning i det dagliga arbetet. Det görs bland annat genom att sensorer installeras istället för strömbrytare, för att minska risken att lampor glöms påslagna i tomma rum. Samtidigt delas belysningsytorna upp, så inte stora ytor automatiskt tänds upp, när det räcker med en mindre yta.
Världskulturmuseerna arbetar också med att minska sina avfallsmängder och skapa cirkulära flöden av material. I flera av utställningarna finns material som använts tidigare i andra utställningar. I utställningen Yokai - japanska väsen, på Etnografiska museet i Stockholm finns takpannor från det gamla nedbrunna tehuset som tidigare stod i parken, och i utställningen Korsvägar på Världskulturmuseet är stor del av möblemanget skapat av återbrukat material.